Як і у всіх представників цього сімейства, коренева система огірка стрижнева, з дуже довгим головним коренем, який може сягати півтора метрів, йдучи вглиб землі. Але це ще не все. Першорядні коріння залягають зовсім близько до поверхні, утворюючи цілу мережу.